Entre los documentos de Santa María de Obarra está el conocido como Rollo de Vallabriga, donde se narra la historia de este lugar durante el último tercio del siglo XI. En 1223 Bernat de Erill y su esposa Major vendieron la villa de Vallabriga con todos sus dominios y derechos al abad de San Victorián y al prior de Obarra

Hacia 1920 se construyó un nuevo templo en la parte alta del pueblo, para su construcción se utilizaron muchos sillares de la antigua iglesia románica.

Por este motivo hoy en día, sólo se conservan unas cuantas hiladas del muro sur y una parte del ábside semicircular con que estaba rematada la nave a levante. Actualmente sirven de valla para el cementerio de la población.

En el nuevo templo se conserva una pila bautismal de piedra, decorada con arcos ciegos. También se conserva la pila de agua bendita, ambas procedentes del antiguo templo románico.